，除了某些形式的皮肤癌，乳腺癌是女性中最常见的癌症。它也是西班牙裔女性中最常见的死于癌症的原因，仅次于肺癌，是所有其他女性中第二最常见的死因。乳腺癌的类型不同，因此有多种替代治疗方法。确定患者的特定癌症类型有助于医生确定哪种疗法最合适。
在贝勒医学院，Meenakshi Anurag博士和她的同事运用精密数据科学来改善乳腺癌的诊断，治疗和生存率。在最近的一项研究中，研究人员研究了雌激素受体阳性(ER +)乳腺癌，该类型代表了近75%的乳腺癌病例。
贝勒大学医学助理教授，这项工作的第一作者，同时是该书的作者之一，阿努拉格说：“内分泌疗法已大大改善了ER +乳腺癌患者的预后;但是，约有三分之一的病例对此疗法无效。”““在这里，我们专注于对内分泌药物(如芳香酶抑制剂)具有抵抗力的ER +乳腺癌。”
ER +乳腺癌可分为两种亚型：A型腔和B型腔。与A型腔相比，后者更具侵略性，显示出更高的肿瘤增殖率和较差的患者生存率。
“在临床试验中，近50%的管腔B型女性对内分泌治疗的反应较差，” Anurag说。“这一结果促使我们寻找可以改变的肿瘤特征，以使癌症更易于治疗。”
搜索基因组
为了寻找使这些癌症更易于治疗的原因，研究人员进行了无偏见的全基因组分布分析。通过这种类型的分析，他们希望从基因组的20,000个基因中识别出与易受治疗的肿瘤相比，在对内分泌治疗耐药的肿瘤中更具活性的基因。
“一开始，我们不知道在这个过程中会发现什么。整个转录组的分析分析使我们能够鉴定出可能与不良结果有关的任何基因，” Anurag说。
Anurag和她的同事研究了66例管腔B例，其中一半对内分泌治疗有抵抗力。他们发现，在抗药性肿瘤中最常活跃表达的基因是免疫检查点基因，它们是免疫系统的调节剂。这些基因产生的蛋白质通常可以控制免疫系统，从而防止T细胞(一种免疫细胞)肆意攻击其他细胞。
在某些癌症中，免疫检查点基因的激活还可以阻止T细胞杀死癌细胞。IDO1基因是免疫检查点，是与腔B型内分泌治疗耐药性癌症最相关的基因。
“这项发现很重要，因为我们知道可以使用称为免疫检查点抑制剂的药物来操纵免疫检查点途径，” Anurag说。抑制癌症中的免疫检查点就像消除使免疫系统免受肿瘤侵袭的“刹车”一样。”
不可预见的可能性
这项研究具有重要意义，因为据认为ER +乳腺肿瘤对免疫疗法无反应，Anurag解释说。“但是我们已经表明，对内分泌治疗有抵抗力的管腔B型乳腺癌子集可以激活免疫应答，这些免疫应答可以通过免疫疗法进行处理，” Anurag说。
“本文发现了一个重要的错失机会-用免疫检查点疗法治疗侵袭性ER +乳腺癌。尽管目前免疫治疗的重点几乎全部集中在三阴性乳腺癌，但我们认为这一重点排除了多达一半的患者谁会受益，因为抵抗内分泌疗法的管腔B型疾病与三阴性乳腺癌一样普遍。”通讯作者，莱斯特和苏·史密斯乳房中心教授兼主任，精确度副主任马修·埃利斯博士说。 Dan L Duncan综合癌症中心的医学和Baylor的McNair Scholar。
“我们的发现突出了个性化药物的重要性。在治疗之前对患者进行正确的分层将有助于确定可能对针对免疫检查点的治疗产生反应的个体，” Anurag说。